הכנסייה המרונית החדשה, הנמצאת בסמוך למנזר ישו הנער, נבנתה לאחרונה על מנת לתת מענה לצורכי הפולחן של בני העדה המרונית בנצרת. המרונים הם קתולים הנקראים ע"ש מרון מסוריה שנדד באזור, הטיף בפני תושביו וקנה לו עדת מאמינים נאמנה. כיום, נמצא המרכז המרוני בלבנון, שם גם יושב הפטריארך המרוני. בנצרת יש כיום כ – 1,100 מרונים. בכנסייה החדשה ניתן להתרשם ממיצג אומנותי של פסלים וציורים מעשה ידי האמנים האיטלקים Tese ו – Lamagna המתארים את פחדיה של האם: מלחמה, סמים ומוות.
בראש העדה המרונית בנצרת עומד האב יוסף עיסא. עיסא, מעקורי בירעם, למד בנעוריו בנצרת ואח"כ למד באיטליה תיאולוגיה ופילוסופיה. ב – 1977 קיבל את הסמכתו ככומר ולמד שנתיים נוספות במוסד פרנציסקאני בירושלים. מ – 1979 הוא גר בנצרת ומנהיג את הקהילה הדתית המרונית.